Panamá é, de acordo com a Conservation International, parte do hotspot de biodiversidade mesoamericana esticando todo o caminho através da América Central tropical do México. Sua reserva de La Amistad International Park e Biosfera, compartilhado com Costa Rica, é a maior área de floresta intocada nuvem na América Central. Conservation International estima que 75% das aves migratórias do Hemisfério Ocidental convergem para o parque. Um estudo recente do Centro do Instituto de Pesquisa Tropical Smithsonian para a ciência tropical da floresta descobriram que as florestas do Panamá são mais de natureza diversa do que os da Amazon. Panamá é o lar de espécies ameaçadas de extinção como a onça e Tapir da Baird, bem como muitas outras criaturas menos conhecidas.
Golden Frog panamenha
O sapo dourado panamenho (Atelopus zeteki) é agora pensado para ser extinta na natureza depois dos últimos rãs conhecidas foram levados para o cativeiro para protegê-los de um fungo mortal. Nativa da montanha florestas tropicais no centro-oeste do Panamá em altitudes entre 1.100 e 4.300 pés, ela foi encontrada em córregos da montanha. O sapo dourado panamenho não coaxar mas as ondas sua mão para sinalizar a outros sapos. É o animal nacional do Panamá.
Macaco Aranha ornamentado
O macaco-aranha ornamentado (Ateles geoffroyi ornatus) é uma subespécie ameaçada de macaco-aranha de Geoffrey que é encontrada apenas em Panamá e Costa Rica. Não se acredita ser de cerca de 30 macacos restantes na vida selvagem na floresta tropical primária perto da costa do Oceano Pacífico. A subespécie está ameaçada pela caça ilegal, bem como pelo desmatamento e de perturbação de seu habitat.
Aguia de rapina
A harpia (Harpia harpyja) é a maior águia no Novo Mundo e é encontrado no Sul e América Central, bem como Panamá. harpias viver na floresta não perturbada e se alimentam de preguiças, macacos e aves. A espécie é o pássaro nacional de Panamá, mas é considerada ameaçada de extinção pela Convenção sobre o Comércio Internacional de Espécies Ameaçadas de Fauna e Flora Selvagens (CITES). Não são pensados para ser mais de 200 casais reprodutores no Panamá, embora a destruição do habitat e caça ilegal continuam a ameaçar a harpia.
Tartarugas marinhas
5 espécies de tartarugas marinhas visitar águas do Panamá e há nidificação importantes para a tartaruga altamente ameaçadas de-couro (Dermochelys coriacea) na sua costa das Caraíbas em Bocas del Toro. tartarugas variam amplamente nos oceanos, mas sempre voltar ao mesmo lugar para se reproduzir. Eles estão ameaçados pela coleta de ovos, bem como por estar preso em linhas de pesca e redes. O Turtle Conservancy Mar estima que existam cerca de 35.860 fêmeas de nidificação restantes no mundo, dos quais até 14.005 vêm se aninhar em praias panamenhas.