Como fazer árvores filogenéticas

Uma vaca pode ser o organismo modelo para a construção de uma árvore filogenética.

A árvore filogenética é uma representação gráfica das relações evolutivas que demonstra como organismos poderia ter divergiram de um ancestral comum. Anteriormente, isso foi feito através da comparação da anatomia e fisiologia dos organismos e fósseis vivos, mas agora a informação genética tirada de sequências de nucleotídeos do DNA é comumente usado. Organismos com algumas semelhanças podem ser encontradas na separada "ramos" de uma árvore filogenética e aqueles com características comuns específicas seria localizado na "galhos" do mesmo ramo. Uma árvore filogenética é um método para a compreensão espécies e mudanças evolucionárias em organismos.

Coisas que você precisa

  • conjunto de dados (ou seja, sequências de nucleotídeos, organismo fotos)
  • Cartolina
  • Cola
  • Caneta
  • Computador (para procedimentos de sequências de nucleótidos avançados somente)
  • Selecione um organismo modelo para comparação relacionamento. Isto pode ser feito com uma sequência de espécies, raça ou de nucleótidos que representa um organismo. Um exemplo organismo ser uma vaca. O resto da árvore seria demonstrar como intimamente relacionado a vaca é para outros organismos com base em características genéticas.

    Fotolia.com"-Modal-conteúdo de dados =" vaca. vaca imagem Exploração agrícola / campo no por L. Shat de Fotolia.com">Uma vaca pode ser o organismo modelo para a construção de uma árvore filogenética.
  • Escolha um grupo externo. Um grupo externo é um organismo menos estreitamente relacionado ou sequência de nucleotídeos muito diferente. Se o organismo modelo é uma vaca, em seguida um possível grupo externo seria um peixe. Os mais diferentes forem dois organismos, o mais para baixo na árvore filogenética será o seu ponto de ramificação divergentes. O tempo é representado com a data mais antiga no fundo do gráfico e hoje sendo na parte superior do gráfico. A colocação dos ramos mostra aproximadamente quando no passado uma característica evolutiva possivelmente um organismo alterado ancestral em espécies diferentes.

    Fotolia.com"-Modal-conteúdo de dados =" imagem Peixes por cherie de Fotolia.com">Peixe fazer uma boa outgroup, como eles aren`t closely related to cows.


  • Determine um conjunto de características de utilização para comparação. Exemplos incluem "tem quatro pernas," "mastiga rumina," "dá à luz ao vivo" ou "cresce o cabelo." As sequências de nucleótidos são representações apenas alfabéticas de ADN que determina as características, de modo que uma outra opção seria: "contém a sequência ATGGACACGGA."

    Fotolia.com"-Modal-conteúdo de dados =" imagem Pé touro por Gina Smith de Fotolia.com">& Amp; quot-Tendo em quatro pernas & amp; quot- é uma maneira de caracterizar organismos separados em grupos.
  • Divida organismos com base nas características. Quando um organismo não contém a característica desejada, é feita um ramificação na árvore filogenética. Para o characterisitic "tem quatro pernas," vacas, ovelhas e cervos seriam todos em um ramo, enquanto o peixe seria em um ramo separado. Colar a imagem ou sequência de uma vaca no canto superior da placa do poster e os peixes no canto oposto e desenhe duas linhas a partir deles para a base do papel em forma de V de intersecção.

  • Continue separando os organismos-modelo ou sequências de nucleótidos até que cada exemplo tem uma única separação do ramo em um galho. a característica "tem lã" iria separar as ovelhas dos veados e vacas em um ramo singular. Coloque a imagem das ovelhas perto a imagem do peixe e desenhar uma linha que liga em forma de V para baixo para o ramo da vaca. Usando a característica "tem cauda felpuda" demarcar vaca de veado. Colar a imagem do cervo entre a vaca e ovelha e desenhar uma outra linha em forma de V que se cruza acima das linhas de peixe e ovinos. Quando cada espécie tem um único ramo, a árvore filogenética foi concluída.

    Fotolia.com"-Modal-conteúdo de dados =" imagem Carneiros por huisman wilmar de Fotolia.com">Carneiros podem ser separados a partir de vacas veados e pela característica de lã.

dicas & avisos

  • Escolha um conjunto finito de organismos ou sequências.
  • Escolha características ou sequências que dividem os organismos em grupos separados.
  • Ter vários suportes característicos para demonstrar relações organismo.
  • posição filogenética pode ser debatido com base em muitas características, e muito apoio é necessário para opções de posicionamento. As equações matemáticas pode ser necessário para demonstrar a probabilidade estatística de mudanças evolucionárias. Probabilidade de divergência no nível genético deixa espaço para possíveis imprecisões nas árvores filogenéticas.
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