Como calcular Desequilíbrio de Ligação

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O desequilíbrio de ligação é um conceito importante no genética que ocorre quando um genótipo de um locus é dependente de um genótipo em outro lugar. A dependência destes dois genótipos significa que a frequência de certas combinações de alelos pode ser diferente do que o que seria de esperar quando se considera os alelos separadamente. desequilíbrio de ligação é um conceito importante para compreender quando se estuda a recombinação genética, e pode ser calculada com uma compreensão suficiente de genética e probabilidade.

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Calculadora

Determinar a freqüência de haplótipos. Por exemplo, se você tem um período de dois loci (A, B), cada um com dois alelos (A1, A2, B1, B2), que haverá quatro haplótipos: A1B1, A1B2, A2B1, A2B2. Como um exemplo, suponha as frequências são 0,5, 0,25, 0,15 e 0,1, respectivamente.
Determinar as freqüências alélicas em termos de frequência de haplótipos. Por exemplo, para encontrar a frequência do alelo A1, você resumiria o A1B1 frequências e A2B2 (no nosso exemplo, 0,5 e 0,25, respectivamente, dando 0,75), e para encontrar a frequência do alelo B1, você resumiria as frequências de A1B1 e A2B1 (no nosso exemplo, 0,5 e 0,15, respectivamente, dando 0,65).
Multiplicar as freqüências dos alelos A1 e B1 da etapa anterior em conjunto. Em forma de equação, isso parece (A1B1 + A2B2) * (A1B1 + A2B1). No exemplo acima, as frequências são de A1 e B1 são 0,75 e 0,65, respectivamente. Multiplicando os números juntos dá 0,4875.
Subtrair a frequência de haplótipos do A1B1 a partir do Passo 1 por o valor obtido a partir do Passo 3. O número resultante é o desequilíbrio de ligação. No nosso exemplo, a frequência de haplótipos de A1B1 é de 0,5 e o valor da etapa 1 é 0,4875, resultando em um valor do desequilíbrio de ligação de 0,125.