O que é que o etanol fazer em uma extração de dna?

DNA extrair é um primeiro passo fundamental na análise molecular.

Antes de ADN pode ser sequenciado, testado ou analisado, ele deve primeiro ser extraído a partir de células. As células contêm muitas outras moléculas como proteínas e lipids- no entanto, e um cientista naturalmente quer obter uma solução de DNA que é tão puro quanto possível. Os métodos comuns de extracção de DNA envolve o uso de isopropanol ou etanol, em uma etapa do processo.

propriedades

  • Tanto o etanol e o isopropanol mistura bem (são miscíveis com) água, mas que têm constantes dieléctricas inferiores do que a água, o que significa que a sua capacidade para proteger cargas positivas e negativas na solução e mantê-los segregado é muito mais pobre. A constante dieléctrica da água, por exemplo, é de 78,5, enquanto que a constante de etanol é 24,3. DNA é carregado negativamente, por isso é atraído por íons positivos na solução como potássio ou sódio. O etanol tem uma menor capacidade do que a água para manter os iões carregados positivamente e o DNA separados.

Concentração



  • O etanol também faz com que o DNA menos solúvel por outra razão. Uma vez que as moléculas de etanol pode formar interacções chamadas ligações de hidrogénio com moléculas de água, eles diminuem o número de moléculas de água disponíveis para hidratar o ADN. Entre este efeito e a constante dieléctrica mais baixa, o etanol, basicamente, faz com que o ADN para agregar com iões positivos na solução, formando um sólido ou precipitado no fundo do tubo. Precipitar o DNA serve para o tornar mais concentrada, porque outros contaminantes na solução não são precipitados ao mesmo tempo.

considerações

  • A lavagem com etanol, também serve para remover os contaminantes de baixo peso molecular, como os sais e detergentes. O sal escolhido pode variar dependendo se é necessária para precipitar o detergente de sulfato de dodecilo de sódio a partir de um dodecil sulfato de potássio da etapa anterior, por exemplo, é insolúvel e vai precipitar, portanto, usando acetato de potássio em uma lise alcalina pode remover o SDS antes do etanol / isopropanol é adicionado. O etanol também pode ser usado para precipitar o ARN por muitas das mesmas razões, embora a precipitação do ARN irá normalmente precisar de mais etanol.

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